La Capselle bourse-à-pasteur est une plante à tige dressée et peu poilue de 20 à 50 cm de hauteur. Les fleurs et les fruits cohabitent souvent, fleurs en haut et fruits en bas, on peut observer ses fameux fruits en forme de cœur, quasiment toute l'année. Sa tige dressée, simple ou ramifiée, est pleine avec une consistance herbacée à section ronde, surface lisse et sans poils. Ses feuilles ont la particularité de ne pas avoir toutes la même forme. Celles de la base sont réunies en rosette et sont le plus souvent très divisées, d'autres poussent sur la tige et sont généralement moins découpées, alternes avec une base embrassante formant des oreillettes rondes, leurs deux faces sont poilues. Ses fleurs sont petites et blanches de 1-2,5 cm regroupées en grappe allongées et assez denses, elles sont portées par des tiges de quelques centimètres de haut. Elles présentent 6 étamines libres, de taille différente (2 plus courtes). Les filets des étamines sont glabres. Le pistil est surmonté d'un seul style assez court. La corolle est formée de 4 pétales égaux, libres, avec l'extrémité arrondie à base amincie. Ses pétales (4 pétales) sont blancs 2 fois plus longs (2-3 mm) que les sépales verts. Le calice est glabre. Il est formé de 4 sépales libres ovales, appliqués sur les pétales.1